支付进口货物的境外运费的税务问题

问：合肥C有限公司从日本企业进口一批货物，另立合同支付日本厂在其境内的运费，到税务局大厅的对外支付备案窗口进行备案时，税务局审核人员认为进口货物境外运费应该计入关税的完税价，拒绝企业通过服务贸易方式对外支付，请问要怎么处理？

答：按海关的规定，进口货物报关的价格要核算到海关报关前的一切支出；日本境内的运费既然是由中国境内的合肥C公司支付，自然要算进报关单的运费栏位，合并购买价格一同课征进口税与进口环节增值税。

如果是还没办理报关进口，请于报关进口时，向海关提交该运费《合同》或《协议》、支付运费的《水单》。

如果已经进口完成，请向海关办理自查自报，提交该运费《合同》或《协议》、支付运费的《水单》、原《进口货物报关单》，补交进口关税与进口环节增值税。

前述补征的缴款书，可以参与增值税纳税申报表的抵扣；否则，日后被海关发现此情节，有机会被以瞒报走私处理外，补征的增值税无法参与增值税纳税申报表的抵扣。